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按照茎的变态来分：有茎卷须、茎刺、根茎、块茎、鳞茎、球茎等.
茎卷须
在植物的茎节上,不是长出正常的枝条,而是长出由枝条变化成可攀援的卷须,这种器官称为茎卷须.如葡萄茎茁壮成长的节上,即生有茎卷须.常见的茎卷须中,有分枝和不分枝的两种情况.有一种很特殊的形态,就是在卷须分枝的末端,膨大而成盘状,可分泌粘质,成为一个个吸盘,粘附于它物上,使植物体不断向上生长,如爬山虎.
茎刺
在植物的茎节上,长出的枝条发育成刺状,称为茎刺.同茎卷须一样,茎刺也有分枝和不分枝两种,前者如皂荚,后者如枸桔、山楂.在许多植物体上都可以看到刺,刺的形态、质地、着生的部位,常常为我们提供了识别植物的有用的依据.植物体上的刺,大体上有三类,一是茎刺,二是皮刺,三是托叶刺,三者的形态、质地、着生部位都有所不同.茎刺来源于枝条,质地坚硬,呈木质,不易折断和剥落,着生位置始终在节上；皮刺来源于植物体的表皮,质地较软,呈草质,易于剥落,着生位置不固定,在茎上、叶片上、叶柄上都可出现；托叶刺则来源于托叶,由托叶演变而来,质地不一,但着生位置基本上都在叶柄的基部,常成对出现.正确区分上述三种刺是识别植物的重要前提.
根茎
根茎或称根状茎,是某些多年生植物地下茎的变态,其形状如根,称为根茎,如芦苇、莲、毛竹都有发达的根茎.俗称的“芦根”就是芦苇的根茎,藕就是莲的根茎,竹鞭就是竹茎的根茎.尽管不同的植物根茎形态各异,但它们都具有一些共同的特征.首先根茎都是长在地下,以水平横向的方式生长,其次在根茎上可以看到茎的基本形态特征,就是有节,节间,在节上也长叶,在叶腋中同样也生有侧芽（这便是区分茎和根的最基该方法）.根茎的节通常是很明显的,如藕、黄精,它们的节间呈肥厚肉质；有些植物的根茎节间细长,如芦苇、白茅.在根茎上所生长的叶,其形态与正常的叶不一样.通常呈薄膜状或鳞片状,不呈绿色,包围在节上.在根茎的顶端生有顶芽,能不断向水平方向生长；在侧面有侧芽,冬笋就是毛竹根茎上的侧芽.
块茎
某些植物的地下茎的末端膨大,形成一块状体,这种生长在地下呈块状的变态茎称为块茎,如马铃薯的薯块.菊芋的地下茎也会膨大成块茎,俗称“洋生姜”.在块茎上同样可能看到茎的特点,如有节、节间、退化的小叶,以及顶芽、侧芽等,如果我们在一块放置比较久的马铃薯块上仔细地观察,可以在它上面看到许多凹穴,在一侧许多凹穴的中心有一个芽,这就是顶芽,其周围许多凹穴中生有多个侧芽；在凹穴的稍下侧有一半圆形横脊,这就是节,在新鲜的薯块上,横脊上可看到有一细小的鳞片状叶.
块茎与块根常常使初学者混淆不清,其实只要运用根和茎的区别,观察一下有没有节和侧芽,在节上有没有退化的叶,就可以很容易把两者区别开来.
鳞茎
某些植物的茎变得非常之短,呈扁圆盘状,外面包有多片变化了的叶,这种变态的茎称为鳞茎,如洋葱、大蒜、百合等.上述三种植物都具有鳞茎,但这三种鳞茎的构造又稍有不同.洋葱的鳞茎四周是一层层套叠的肉质鳞片,把扁平状高度压缩的茎紧紧地围起来,外侧有几片薄膜干枯的鳞片,是地上叶的叶基.地上叶枯死后,叶片基部干枯呈膜质,包在整个鳞茎的外面.大蒜在成熟后,鳞茎（即食用的大蒜头）的底部因木质化而变得紧硬起来,外围的膜质叶基干枯而无食用价值,膜质叶间的腋芽却充分地生长起来,显得肥厚而呈肉质,即食用的大蒜瓣.百合的鳞茎由许多半月形的肉质鳞片相互覆盖在缩短了的茎上而形成.显然鳞茎的形态各有不同,但都可能在它们上面看到茎的特点,有节,有缩短了的节间和叶片.
球茎
某些植物的地下茎先端膨大成球形,称为球茎,如荸荠、慈菇、芋艿.球茎是块茎与鳞茎之间的中间类型,外形似鳞茎,结构近似块茎,常有发达的顶芽,节和节间明显可辩,并具有腋芽,鳞叶稀疏而呈膜状.通常球茎全部埋于泥中.
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