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牛顿一直都在研究神学，他对于宇宙的观念一直都是宗教的，是带有万能的“上帝”性质的。
牛顿出生在一个宗教氛围浓厚的年代，那个年代里，异教徒是需要上火柱烧死的。而他的继父还是有着宗教信仰的牧师，自然也会对他造成影响。
因此，从小时候开始，他对事物的思考，是带有宗教的思想在里面的。哪怕是长大以后，他的“科学思想”，依然是用一个上帝，来解释事物的规律。而那些规律，就是上帝的手所拨动的。
就好像我们所熟知的万有引力定律。在牛顿看来，“重力解释行星的运行，但不能解释谁使行星运行。上帝治理万物，知道一切可做或能做的事”。他承认有客观规律的存在，这在现在我们视为是科学。而在科学的背后，还有他的下半句，是“上帝治理万物”。
当然，科学家并不需要神学，后来人也不需要宗教信仰，后面的句子，就被人为的忽略了。
此外，造成这种印象的，实际上还是当时宗教神学的原因。
在正统的思想里面，是不存在规律的，所有的一切都是上帝所为。而牛顿的思想，虽然存在上帝，但是居然提出了有客观规律的存在，如果赤裸裸的说出来这种观点，肯定会被拉上火柱，被正统教徒烧死……异端，是不允许存在的。
所以在牛顿的著作里面，在生前未被发表的草稿里面，有着大量的神学内容，也有客观规律的内容。他一直都有宗教信仰，都有神学思想。
而在晚年的时候，为什么要凸显出神学的地位，而减少了科学的内容，让人看起来“牛顿是不是自己打自己脸了”？
实际上并不是这样。
他所有的科学规律，都是上帝在推动。当他研究得越深，他就会距离他的“上帝越近，自然就越来越多地涉及到“神学”的内容。
牛顿晚年研究神学，是进步还是退步
据说牛顿对圣经中的《但以理书》和《启示录》两卷的研究广博精深。他确信圣经中有密码，他认为比万有引力更重要。因此他勤学希伯来文，努力求索圣经密码，甚至预言了世界末日的具体时间，因此花了一半人生。
牛顿的这种科学精神令人佩服，虽然他的神学研究没有他的万有引力定律更被人熟知。大概是因为要揭开神的奥秘不能靠来于人的研究，而是来自于神自己对人的启示和宣告。
大多数人特别是没有研究过物理学史的人认为，牛顿晚年之所以研究神学，是因为他解释不了很多现象的最根本的原因，比如为什么会有万有引力？他得出，这是神的第一推动力。实际上这种讲法是不正确的。想知道牛顿是否迷信以及了解他做出的种种事。必须先研究他的思想。
牛顿生于1642年12月25日（当时的一种历法，好像是夏历），公历是1643年1月4日。由于牛顿生于12月25日。大家都知道这是什么日子吧？对了，圣诞节。所以你顿从小就认为自己和神有渊源。这很正常，换做是我们，如果出生日某个特殊的日子，也会想出很多东西来。牛顿之前物理学可以说有伽利略刚刚起步，一切都尚不明朗。牛顿性格孤僻，极端复杂。源自于他是个早产儿，并且父亲在他没有出生就已经去世，继父是个神父，但年龄很大，从小牛顿没有母爱，继父死后，和母亲一起却发现自己多了弟弟妹妹。牛顿还经常虐待他们。总之牛顿心理上有一定的问题。
牛顿虽然认为他和神有渊源，从小就十分虔诚，但是他和其他的基督教徒不同的是，基督教徒是通过圣经来研究神和自然的。牛顿则认为，想要更好的研究神和自然界，不是去研究圣经，而是直接去研究自然，只有把自然真正研究透彻，才能更好的理解神传达的旨意。所以牛顿去研究自然科学。注意：牛顿研究科学就是为了更好的研究神！所以当他的名著：自然哲学的数学原理，问世以后，贝克莱大主教，就问他，为什么你的著作里没有神的存在，牛顿为了避免贝克莱的非难，在万有引力里加入了神的第一推动力，实际上，他自己也根本不知道为什么会有万有引力，在当时这也是他能找到的最好的解释了。万有引力问题很复杂，爱因斯坦提出广义相对论后才给出现在认为正确的解释：那就是世界上根本没有万有引力，万有引力是一种几何效应，并没有这个力。这种几何效应使得似乎有这个力的存在，就像惯性力不存在一样，但在非惯性系中却必须引入这个力。当然量子力学却不这么解释。总之引力问题很复杂。牛顿自然解决不了。他提出了神的第一推动力。
牛顿在他的巨著：自然哲学原理，面世之后，取得了巨大的成功，对当时的物理现象给出了很好的解释。然而，牛顿关于研究自然以研究神的事业并没有完成。因为第一推动力还没找到。类似的情况也还有。而当时的物理已经被他研究的差不多了，所以他只能通过研究神学，来解决这个问题。因而你顿晚年潜心研究神学。
牛顿一直是一个宗教徒，并不是通常人们想象的那样，牛顿开始研究科学，后来不行了，研究神学,错，他一直研究神学，只不过他不是通过圣经研究神学。
牛顿谈不上迷信与不迷信，看你怎么解释这个问题。我们对牛顿有很多的误解，上面的就是一例。类似的也还有，比如牛顿有一句名言：如果说我看他比别人远，那是因为我站在巨人的肩上。这句话被理解为牛顿很谦虚，也告诫我们，必须研究前人的成果，在前人的基础上才能做出大贡献。但是，牛顿说这句话的时候，并非是这个意思，牛顿说这句话是为了讽刺胡克。众所周知，牛顿和胡克矛盾很深。他说这句话的目的就是讽刺胡克。具体情况可以到晚上查。
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